近日,中國科學院院士、復旦大學附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院教授黃荷鳳團隊在《細胞發(fā)現(xiàn)》發(fā)表論文,展示了一種全新的無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)方法,首次實現(xiàn)了同步篩查染色體病和單基因病,同時大幅提高了無創(chuàng)產(chǎn)前篩查對目標疾病的檢測性能。
NIPT用于檢測常見的胎兒染色體非整倍體問題已有十多年歷史,成為阻斷由染色體疾病造成的遺傳性出生缺陷的主要臨床手段。除了對唐氏綜合征等非整倍體疾病的檢測外,NIPT不僅已擴展到染色體微缺失和微重復綜合征,也可用于篩查如軟骨發(fā)育不全等常見單基因病。
然而,目前的NIPT技術(shù)還無法同步檢測染色體病和單基因病。受雙(多)胎、母體染色體變異、雜合性缺失攜帶者等復雜因素干擾,NIPT對目標疾病檢測性能也不高。
在該研究中,研究人員利用一種全新技術(shù),協(xié)同等位基因靶向富集測序?qū)δ柑ビ坞xDNA(cfDNA)進行多維分析,解決了第一代NIPT的缺陷。
該技術(shù)通過一種新穎的液相雜交捕獲探針設(shè)計,高度均一地對靶標染色體區(qū)域內(nèi)單核苷酸多態(tài)性位點的野生型和突變型等位基因片段化DNA進行富集,產(chǎn)生高信噪比的cfDNA測序數(shù)據(jù),并利用新的基因組算法分析目標區(qū)域的測序深度、等位基因分數(shù)、連鎖SNP(單核苷酸多態(tài)性),精確地分離胎兒基因組和母體背景。
“通過技術(shù)突破,我們實現(xiàn)了對包括多胎妊娠、母體拷貝數(shù)變異和雜合性丟失在內(nèi)的分析干擾因素的準確識別,提高了對目標疾病的檢測性能。”論文共同通訊作者、復旦大學附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院主任醫(yī)師吳琰婷介紹,“我們在1129例回顧性樣本中,檢測到54個胎兒非整倍體、8個微缺失/微重復和8個單基因變異,靈敏度為100%,特異度為99.3%。”
同時,該研究還在cfDNA中首次發(fā)現(xiàn)了60.3%的非整倍體樣本中存在減數(shù)分裂重組異常,為進一步研究減數(shù)分裂機制提供了重要啟示。
“胎兒發(fā)育過程中如果沒有嚴重結(jié)構(gòu)異常,單基因病可能會在孕早期超聲篩查中被漏檢,新一代NIPT可以進行更全面的基因篩查。”黃荷鳳表示,“將單基因病納入現(xiàn)有的NIPT篩查體系具有顯著的臨床價值,是下一代NIPT的發(fā)展方向,將進一步降低遺傳性出生缺陷,為新生命保駕護航,具有重要的推廣意義。”
(張雙虎 黃辛)
關(guān)鍵詞: 篩查染色體病和單基因病首次實現(xiàn) 大幅提高無創(chuàng)產(chǎn)前篩查檢測性能 第一代NIPT的缺陷 液相雜交捕獲探針設(shè)計
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