近日，中國科學(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院教授黃荷鳳團(tuán)隊(duì)在《細(xì)胞發(fā)現(xiàn)》發(fā)表論文，展示了一種全新的無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)方法，首次實(shí)現(xiàn)了同步篩查染色體病和單基因病，同時(shí)大幅提高了無創(chuàng)產(chǎn)前篩查對(duì)目標(biāo)疾病的檢測性能。

NIPT用于檢測常見的胎兒染色體非整倍體問題已有十多年歷史，成為阻斷由染色體疾病造成的遺傳性出生缺陷的主要臨床手段。除了對(duì)唐氏綜合征等非整倍體疾病的檢測外，NIPT不僅已擴(kuò)展到染色體微缺失和微重復(fù)綜合征，也可用于篩查如軟骨發(fā)育不全等常見單基因病。

然而，目前的NIPT技術(shù)還無法同步檢測染色體病和單基因病。受雙(多)胎、母體染色體變異、雜合性缺失攜帶者等復(fù)雜因素干擾，NIPT對(duì)目標(biāo)疾病檢測性能也不高。

在該研究中，研究人員利用一種全新技術(shù)，協(xié)同等位基因靶向富集測序?qū)δ柑ビ坞xDNA(cfDNA)進(jìn)行多維分析，解決了第一代NIPT的缺陷。

該技術(shù)通過一種新穎的液相雜交捕獲探針設(shè)計(jì)，高度均一地對(duì)靶標(biāo)染色體區(qū)域內(nèi)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的野生型和突變型等位基因片段化DNA進(jìn)行富集，產(chǎn)生高信噪比的cfDNA測序數(shù)據(jù)，并利用新的基因組算法分析目標(biāo)區(qū)域的測序深度、等位基因分?jǐn)?shù)、連鎖SNP(單核苷酸多態(tài)性)，精確地分離胎兒基因組和母體背景。

“通過技術(shù)突破，我們實(shí)現(xiàn)了對(duì)包括多胎妊娠、母體拷貝數(shù)變異和雜合性丟失在內(nèi)的分析干擾因素的準(zhǔn)確識(shí)別，提高了對(duì)目標(biāo)疾病的檢測性能。”論文共同通訊作者、復(fù)旦大學(xué)附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院主任醫(yī)師吳琰婷介紹，“我們?cè)?129例回顧性樣本中，檢測到54個(gè)胎兒非整倍體、8個(gè)微缺失/微重復(fù)和8個(gè)單基因變異，靈敏度為100%，特異度為99.3%。”

同時(shí)，該研究還在cfDNA中首次發(fā)現(xiàn)了60.3%的非整倍體樣本中存在減數(shù)分裂重組異常，為進(jìn)一步研究減數(shù)分裂機(jī)制提供了重要啟示。

“胎兒發(fā)育過程中如果沒有嚴(yán)重結(jié)構(gòu)異常，單基因病可能會(huì)在孕早期超聲篩查中被漏檢，新一代NIPT可以進(jìn)行更全面的基因篩查。”黃荷鳳表示，“將單基因病納入現(xiàn)有的NIPT篩查體系具有顯著的臨床價(jià)值，是下一代NIPT的發(fā)展方向，將進(jìn)一步降低遺傳性出生缺陷，為新生命保駕護(hù)航，具有重要的推廣意義。”

(張雙虎 黃辛)

關(guān)鍵詞： 篩查染色體病和單基因病首次實(shí)現(xiàn) 大幅提高無創(chuàng)產(chǎn)前篩查檢測性能 第一代NIPT的缺陷 液相雜交捕獲探針設(shè)計(jì)