中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所(以下簡(jiǎn)稱長(zhǎng)江所)的科研人員發(fā)現(xiàn)，長(zhǎng)江野生魚腸道內(nèi)微生物主要來自與魚類食性相關(guān)的環(huán)境微生物，它們大多只是匆匆過客(暫住者)，和宿主形成穩(wěn)定適應(yīng)的常住者相比占比很低。相關(guān)研究成果近日發(fā)表于《微生物學(xué)前沿》。

為了系統(tǒng)理解腸道微生物和環(huán)境微生物之間的動(dòng)態(tài)關(guān)系，長(zhǎng)江所科研人員提出了一個(gè)簡(jiǎn)化的框架來描述腸道微生物的定殖和動(dòng)態(tài)。水生動(dòng)物在個(gè)體發(fā)育早期，環(huán)境微生物隨水體環(huán)境和餌料一起通過攝食過程進(jìn)入腸道。隨著個(gè)體發(fā)育和免疫系統(tǒng)建立，一小部分進(jìn)入腸道的微生物和宿主之間逐漸建立協(xié)同平衡成為腸道微生物定居者，而大部分進(jìn)入腸道的環(huán)境微生物只是匆匆過客，因腸道內(nèi)環(huán)境及免疫過程的過濾而消失或在腸道微生物群落動(dòng)態(tài)競(jìng)爭(zhēng)演替中消失。所以在成年個(gè)體腸道中，微生物是由不斷進(jìn)入腸道的環(huán)境微生物和已定居腸道的微生物組成的。

為了量化環(huán)境微生物在野生魚類腸道的定殖狀況，研究人員利用16S rRNA基因擴(kuò)增子測(cè)序，對(duì)長(zhǎng)江武漢段水體環(huán)境微生物和10種野生魚類腸道微生物的群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析，量化環(huán)境微生物和腸道內(nèi)微生物之間的關(guān)系。

結(jié)果確認(rèn)，在大多數(shù)個(gè)體中，近80%的腸道微生物和水體環(huán)境微生物相同(除了鱖和短頜鱭偏低，約74%)。在約80%的個(gè)體中，95%以上的腸道微生物物種和OTU(分類操作單元)屬于過客類型。在魚類物種水平，99%以上的引入腸道的微生物物種和OTU是過客。水體環(huán)境微生物中近79%OTUs和89%物種可以被引入魚類腸道。受臨時(shí)微生物引入的驅(qū)動(dòng)，具有相似棲息生境和食性的魚類具有相似的腸道微生物群落。(見習(xí)記者 荊淮僑)

關(guān)鍵詞： 長(zhǎng)江野生魚 腸道內(nèi)微生物 環(huán)境微生物 量化環(huán)境微生物