中國菰原產(chǎn)于中國,屬于禾本科稻族菰屬,主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。其穎果為菰米,在我國古代是重要的“六谷”之一。近日,中國農(nóng)科院煙草研究所與中國水稻研究所、深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所等單位聯(lián)合,完成首個(gè)中國菰染色體水平基因組組裝,并通過共線性分析和轉(zhuǎn)錄組測序鑒定到中國菰落粒性相關(guān)基因。相關(guān)研究成果發(fā)表于《通訊—生物學(xué)》。
論文通訊作者閆寧介紹,中國菰具有生物量大、耐深水、灌漿成熟快、籽粒蛋白質(zhì)含量高和抗稻瘟病等優(yōu)良性狀,由于未經(jīng)過人工馴化,其種子成熟過程中極易脫離母體形成落粒,導(dǎo)致收獲指數(shù)和產(chǎn)量嚴(yán)重降低。因此,開展落粒性相關(guān)研究對于中國菰的快速馴化以及培育落粒性減弱的品種具有重要意義。但是,由于缺乏高質(zhì)量基因組,中國菰的相關(guān)研究遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于水稻等作物。
獲得染色體水平基因組后,研究人員發(fā)現(xiàn),中國菰與假稻和稻屬植物親緣關(guān)系更近,其分化時(shí)間約為3100萬~1970萬年前。研究還發(fā)現(xiàn),中國菰和水稻基因組之間存在顯著的共線性。(記者 李晨 通訊員 鞠曉暉)
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