早在100多年前,科學(xué)家就已經(jīng)在腫瘤內(nèi)檢測出細菌。近日,以色列科學(xué)家又在1500多份腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)細菌的存在。這些菌群是從哪里來的?會促進癌癥的發(fā)生發(fā)展嗎?調(diào)控這些菌群是否有助于治好癌癥?
人體細胞內(nèi)有原癌基因和抑癌基因,當(dāng)這兩種基因在一些條件下變異后,會導(dǎo)致癌癥的發(fā)生。但癌細胞緣何會任性增殖,是否有更復(fù)雜的原因,人們一直在探索。
以色列魏茨曼科學(xué)研究所的一支科研團隊近日在《科學(xué)》雜志發(fā)表論文稱,他們發(fā)現(xiàn)人類腫瘤內(nèi)存在許多細菌。更令人感到神奇的是,這些細菌看似具有腫瘤特異性——不同的腫瘤樣本,細菌的種類也有區(qū)分。
無獨有偶,有國內(nèi)外學(xué)者此間也分別在《自然》《細胞》旗下的iScience以及歐洲微生物學(xué)會聯(lián)合會《微生物生態(tài)學(xué)》發(fā)表了相關(guān)內(nèi)容的論文,讓人們開始逐漸了解腫瘤里微生物組的更多秘密。
百年前已檢測出腫瘤細菌 但系統(tǒng)研究剛剛起步
此次魏茨曼科學(xué)研究所的研究人員分析了乳腺癌、肺癌、黑色素瘤、胰腺癌等常見的7種實體腫瘤,樣本數(shù)超過了1500份。分析結(jié)果確認,大部分的樣本里都含有細菌。令人驚訝的是,這些細菌大多數(shù)都位于細胞內(nèi),包括癌細胞和免疫細胞。
研究團隊還指出,早在100多年前,科學(xué)家就在人類的腫瘤里檢測出了細菌,但一些人認為,這表明細菌在腫瘤的微環(huán)境里可能具有局部的作用;另一些人則指出,這些細菌的含量都非常低,很難確認它們真的來自腫瘤樣本,還是來自外部的污染。
“雖說100多年前人們已在腫瘤里檢測出了細菌,但真正系統(tǒng)深入地研究還不到十年,是非常新的一個領(lǐng)域。”中科院昆明動物研究所(以下簡稱昆明動物所)計算生物與醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)學(xué)科負責(zé)人馬占山研究員,曾擔(dān)任人類微生物菌群研究計劃主要科學(xué)家。他認為,早期菌群研究技術(shù)、癌癥動物模型技術(shù)、人體樣本采集技術(shù)、數(shù)據(jù)分析技術(shù)等還不夠成熟,限制了腫瘤菌群的研究。
馬占山介紹,目前,研究癌癥菌群的方法主要分為兩種,一種用熒光標(biāo)記法來追蹤特定的微生物物種,另一種是16S rRNA測序技術(shù)——細菌的系統(tǒng)分類研究中最有用的和最常用的分子鐘。這些技術(shù)都是100年前所沒有的。此外,最重要的是理念創(chuàng)新不夠?,F(xiàn)今“醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)”可以看作是醫(yī)學(xué)微生物學(xué)、計算生物學(xué)、理論生態(tài)學(xué)和醫(yī)學(xué)研究的交叉領(lǐng)域。2010年在昆明動物所建立的“計算生物學(xué)與醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)”學(xué)科組,是世界上首家以新醫(yī)學(xué)生態(tài)理念為研究重心的實驗室,正致力于搭建人類菌群“醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)”理論的框架。
昆明動物所腫瘤生物學(xué)學(xué)科組負責(zé)人陳策實研究員也認為,已知某些細菌和病毒是促癌的,例如幽門螺桿菌被認為是胃癌的元兇之一,具核梭桿菌促進結(jié)直腸癌的發(fā)生與發(fā)展。但是很多實體瘤細菌數(shù)量少、存在各種細菌混雜的異質(zhì)性;厭氧條件下生長緩慢、難培養(yǎng),以及難以確定是否由取樣污染造成,也是研究難的重要原因。
魏茨曼科學(xué)研究所科學(xué)家采用聚合酶鏈式反應(yīng)擴增16S rRNA,免疫組化檢測細菌表面成分,免疫熒光雜交檢測16S rRNA,以及細菌體外培養(yǎng)、代謝標(biāo)記等多種方法,發(fā)現(xiàn)大部分腫瘤,尤其是乳腺癌和免疫細胞存在胞內(nèi)細菌,這些細菌和腫瘤類型、病人吸煙與否以及對免疫治療的反應(yīng)有相關(guān)性。
新研究的突破在于發(fā)現(xiàn)不同腫瘤菌群的組成、多樣性、代謝通路均不相同,顯示這些不同可用于腫瘤的診斷甚至分型。
瘤內(nèi)微環(huán)境組成復(fù)雜 或與腫瘤耐藥性息息相關(guān)
新研究認為,全世界超過16%的癌癥由傳染性病原體引起,每種腫瘤的微生物組各不相同??扇梭w瘤內(nèi)微環(huán)境怎樣?這些微生物組有哪些特點?微生物組是否參與或影響腫瘤的發(fā)生、發(fā)展?
陳策實向科技日報記者表示,人體瘤內(nèi)微環(huán)境一般有缺氧、高壓、酸性的特點。瘤內(nèi)細菌往往誘發(fā)炎癥和免疫反應(yīng),細菌的毒素也可能誘發(fā)癌變,活細菌的代謝功能可以改變腫瘤細胞微環(huán)境。
“瘤內(nèi)微環(huán)境主要由惡性細胞和遺傳上穩(wěn)定的基質(zhì)細胞組成,其中基質(zhì)細胞包括內(nèi)皮細胞、成纖維細胞和免疫細胞,以及它們生成的細胞外基質(zhì)?,F(xiàn)在想必還應(yīng)該加入微生物細胞。”馬占山認為,其特點是不同腫瘤具有不同的微生物種類,比如結(jié)腸癌中占主導(dǎo)的是擬桿菌和厚壁菌,胰腺癌中占主導(dǎo)的是變形菌,不同腫瘤中的微生物比值也不同。除組成不同外,不同腫瘤的菌群代謝通路也不同。例如,骨瘤細菌中富集了羥脯氨酸降解通路,肺癌細菌中富集了降解香煙中化學(xué)物質(zhì)的通路。甚至不同亞型腫瘤內(nèi)的細菌代謝通路也是有差別的。
“瘤內(nèi)微生物可通過誘導(dǎo)免疫抑制從而促進腫瘤形成;這些微生物還可代謝腫瘤化療藥物,或與腫瘤耐藥性息息相關(guān)。”馬占山舉例說,有研究顯示,與正常肺組織相比,肺的鱗狀細胞癌組織中不但有較高的細菌多樣性,并且還富集著一種特殊的細菌。這種細菌與TP53基因的突變密切相關(guān),此基因的突變,可導(dǎo)致上皮功能損傷。
腫瘤內(nèi)細菌從何而來 還有待深入研究
調(diào)控微生物組是否能預(yù)防和治療腫瘤?陳策實說:“通過飲食、抗生素藥物等控制細菌是可行的。但目前認為抗生素很難進入癌細胞殺死這些細菌,研究顯示腸道微生物控制可以影響腫瘤免疫治療,深入研究實體瘤細菌也許會給腫瘤治療帶來新的途徑。”
從理論上講,若想調(diào)控微生物組,首先要明確這些異常的微生物從何而來,它們到底是從其他地方擴散而來的,還是正常菌群失調(diào)導(dǎo)致的。“因此瘤內(nèi)微生物可能促進癌癥發(fā)生發(fā)展,但是這些細菌是病因還是結(jié)果,可能是巨噬細胞等免疫細胞從其他部位攜帶到腫瘤部位,還是腫瘤血管滲漏導(dǎo)致血液中的細菌感染腫瘤部位?這些問題目前沒法下結(jié)論。”陳策實說。
在健康人體內(nèi),腸道、口腔、肺、生殖道、皮膚等都存在大量共生菌,尤其是腸道。當(dāng)病理因素導(dǎo)致腸道滲透性增強,腸道內(nèi)的微生物就會趁機進入肝臟和腸系淋巴,若肝臟和腸系淋巴免疫失調(diào),微生物就會擴散進周身循環(huán)系統(tǒng),從而侵入其他器官。此外,當(dāng)機體穩(wěn)態(tài)失衡時,共生菌中往日被抑制的病原菌就有可能大量繁殖。只有先把異常微生物的來源切斷,才有可能徹底控制。“但這一點,目前仍在探索階段。”馬占山強調(diào),調(diào)控微生物環(huán)境可消除微生物對免疫系統(tǒng)的破壞作用,減緩惡性細胞突變,延長化療藥物藥效,提高愈后等。這些研究探索,最早是在對艾滋病病毒和猿猴免疫缺損病毒感染治療研究中獲得的。
“但是需要注意的是,目前研究連這些腫瘤組織菌群中哪些是‘敵’、哪些是‘友’都不太清楚,所以這些探索僅僅才起步。”馬占山強調(diào)說。
瘤內(nèi)細菌與癌細胞和免疫細胞之間的相互作用,還有諸多有待突破的關(guān)鍵問題,比如瘤內(nèi)微生物與癌細胞突變、啟動癌細胞轉(zhuǎn)移擴散等方面的關(guān)系,瘤內(nèi)微生物參與哪些免疫反應(yīng)等。此外,瘤內(nèi)細菌的多樣性、功能、起源和作用機制都有待闡明,它們在癌癥診斷和治療方面的價值等,仍待深度挖掘。(趙漢斌)
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