中國農(nóng)科院麻類研究所聯(lián)合國內(nèi)外3家單位,通過基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀修飾組聯(lián)合分析的手段,揭示了黃麻耐鹽適應(yīng)機制和馴化歷史,并通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)發(fā)現(xiàn)黃麻11個重要性狀的候選位點。相關(guān)成果近日發(fā)表于《植物雜志》。
黃麻是全球第二大天然纖維作物,種植面積占全球韌皮纖維的80%??蒲腥藛T聯(lián)合使用多種測序技術(shù),對黃麻耐鹽品種TC008-41的基因組進行測序、組裝以及注釋,通過構(gòu)建13種植物的最大似然樹對黃麻適應(yīng)性進化中的基因家族擴張和收縮進行評估。
結(jié)果表明,擴張的基因家族通過DNA修復(fù)和清除活性氧,增強了黃麻對非生物脅迫的抵抗力。進一步研究發(fā)現(xiàn),在基因家族馴化過程中,進化基因具有明顯的表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄表達(dá)變化,并且一些重要進化基因具有明顯的耐鹽GWAS信號,可能在植物鹽脅迫適應(yīng)性形成中發(fā)揮重要作用,這對黃麻耐鹽性的分子育種具有重要意義。
論文審稿人認(rèn)為,這項成果通過多組學(xué)研究,報告了高質(zhì)量黃麻參考基因組、256份黃麻種質(zhì)基因組重測序、11個農(nóng)藝性狀的GWAS和黃麻對鹽脅迫反應(yīng)的多組學(xué)分析;通過大規(guī)模重測序了解了黃麻的進化歷史,揭示了與耐鹽性、纖維產(chǎn)量和纖維品質(zhì)等重要育種性狀相關(guān)的基因,解析了黃麻耐鹽等逆境適應(yīng)機理。
該研究為與耐鹽性和纖維相關(guān)的黃麻育種提供了寶貴的遺傳資源,并為了解黃麻的環(huán)境適應(yīng)性、馴化和改良遺傳基礎(chǔ)以及一些重要性狀提供了重要信息。(記者王昊昊 通訊員楊澤茂)
關(guān)鍵詞: 農(nóng)科院揭示黃麻耐鹽機制和馴化歷史 發(fā)現(xiàn)黃麻11個重要性狀候選位點 增強黃麻對非生物脅迫抵抗力 高質(zhì)量黃麻參考基因組
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